数据集概述
本数据集包含从南极海葵分离的AG3和AT9两株细菌的全基因组分析结果,通过Prokka进行基因注释,使用antiSMASH分析生物合成基因簇(BGCs),并通过CARD数据库和RGI工具识别抗生素耐药基因(ARGs),为南极微生物功能研究提供基础数据。
文件详解
- Prokka注释文件
- 文件名称:Prokka_AT9.zip、Prokka_AG3.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Prokka 1.11版本对AG3和AT9菌株全基因组的注释结果,涵盖基因结构、功能注释等核心信息
- antiSMASH分析文件
- 文件名称:antiSMASH_AT9.zip、antiSMASH_AG3.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含使用antiSMASH 7.0版本分析得到的两菌株生物合成基因簇(BGCs)相关数据
- CARD分析文件
- 文件名称:CARD_AT9.zip、CARD_AG3.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含通过CARD 4.0.0数据库和RGI 6.0.3工具识别的两菌株抗生素耐药基因(ARGs)相关数据
适用场景
- 南极微生物基因功能研究:分析AG3和AT9菌株的基因注释信息,探究南极细菌的基因组特征
- 生物合成基因簇挖掘:基于antiSMASH结果,筛选潜在的次级代谢产物合成基因簇
- 抗生素耐药机制分析:通过CARD数据研究南极细菌的耐药基因分布与耐药性机制
- 极端环境微生物适应性研究:结合基因注释与功能数据,探讨南极细菌对极端环境的适应策略