数据集概述
本数据集包含Fictibacillus terranigra的分析数据，共13个文件，涵盖基因注释、功能预测、代谢分析等内容，涉及blastKOALA、Prokka注释、microtrait筛选、dbcan3分析、DRAM及METABOLIC结果等多种类型文件，可用于研究该菌株的基因功能与代谢特征。
文件详解
- 基因功能注释文件
- 文件名称：blastKOALA.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含基因座标签（如BIGMCDDJ_00001）与KO编号（如K02469）的对应关系，用于基因功能注释
- Prokka注释文件
- 文件名称：terranigra_prokka.gbk、terranigra_prokka.tsv、terranigra_prokka.faa、terranigra_prokka.gff
- 文件格式：GBK、TSV、FAA、GFF
- 字段映射介绍：
- terranigra_prokka.tsv：含locus_tag（基因座标签）、ftype（特征类型）、length_bp（长度）、gene（基因名）、EC_number（酶编号）、COG（COG分类）、product（产物）等字段
- 其他文件为Prokka注释的不同格式输出，包含基因序列与注释信息
- 功能筛选与预测文件
- 文件名称：rules_filtered_microtrait.txt、counts_microtrait1.txt、counts_microtrait2.txt、counts_microtrait3.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：microtrait相关的筛选规则与计数结果，用于微生物特征预测
- 碳水化合物活性酶分析文件
- 文件名称：overview_dbcan3.txt、dbsub_dbcan3.out
- 文件格式：TXT、OUT
- 字段映射介绍：dbcan3分析的概述与输出结果，涉及碳水化合物活性酶预测
- 代谢分析文件
- 文件名称：DRAM_summary.xlsx、METABOLIC_result.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：DRAM与METABOLIC工具生成的代谢分析结果，包含菌株代谢功能总结
适用场景
- 微生物基因功能研究：通过blastKOALA与Prokka注释文件分析Fictibacillus terranigra的基因功能与分类
- 代谢特征分析：利用DRAM与METABOLIC结果研究该菌株的代谢通路与能力
- 碳水化合物活性酶研究：通过dbcan3相关文件分析菌株的碳水化合物降解能力
- 微生物特征预测：基于microtrait文件预测Fictibacillus terranigra的表型特征
- 生物技术应用研究：为该菌株在工业或环境领域的应用提供基因与功能数据支持
