数据集概述
本数据集为Brachystegia属(豆科、Detarioideae亚科)的系统基因组学研究数据,包含61份样本的靶向富集测序结果,用于探究非洲Miombo林地的起源。数据支持了该属的上新世起源及上新世-更新世的多样化事件,揭示了物种间潜在的杂交进化机制。
文件详解
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据结构及文件描述
- 文件名称:BEAST-DNA_alignment-21-orthologs_additionnal_outgroups.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含21个直系同源基因及额外外类群的DNA序列比对文件,用于BEAST时间校准分析
- 文件名称:global_DNA_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:总长214,545 bp的全局DNA序列比对文件,用于RAxML-NG系统发育推断
- 文件名称:Individual-alignment.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,包含单个基因的序列比对数据
- 文件名称:BEAST-DNA_alignment-21-orthologs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含21个直系同源基因的DNA序列比对文件,用于BEAST系统发育分析
数据来源
论文“Phylogenomics of Brachystegia (Fabaceae, Detarioideae): Insights into the origin of African miombo woodlands”
适用场景
- 植物系统演化研究:分析Brachystegia属的系统发育关系及物种分化时间
- 生物地理学研究:探究非洲Miombo林地的起源与扩张历史
- 基因组杂交分析:通过网络分析研究物种间的基因渐渗与杂交事件
- 豆科植物进化研究:解析Detarioideae亚科植物的分子进化机制
- 生物多样性保护:为Miombo林地生态系统的保护提供进化生物学依据