数据集概述
本数据集基于十字花科19个物种的从头组装转录组,挖掘得到2012个可直接使用的SSR标记及引物序列,同时包含Cochlearia pyrenaica的高质量注释转录组,还测试了Cochlearia属内标记的可转移性与多态性,为十字花科进化研究与遗传分析提供工具。
文件详解
- 文件名称:
README_for_MolRes_for_Brassicaceae.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集的使用说明、数据生成背景、SSR标记信息、注释转录组细节及标记可转移性测试结果等文档内容。
- 文件名称:
MolRes_for_Brassicaceae.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含19个十字花科物种的2012个SSR标记及对应引物序列数据,以及Cochlearia pyrenaica的注释转录组数据,涵盖SSR位置信息、多态性结果等遗传分析相关内容。
适用场景
- 十字花科遗传进化研究: 利用SSR标记分析家族内物种进化关系,验证SSR进化保守性。
- 植物分子标记开发: 直接使用2012个SSR标记及引物开展十字花科物种遗传多样性研究。
- 转录组功能注释: 基于Cochlearia pyrenaica注释转录组,分析SSR在功能基因中的分布位置。
- 遗传标记可转移性测试: 参考Cochlearia属内标记可转移性结果,指导十字花科近缘物种的标记复用。
- 植物遗传育种: 利用多态性SSR标记开展十字花科作物的遗传图谱构建与分子辅助育种。