数据集概述
本数据集围绕冷适应植物柴胡(Bupleurum euphorbioides)冰期避难所种群的遗传特征展开,通过微卫星标记和叶绿体DNA序列分析其遗传结构,并与典型温带物种长辐射柴胡(B. longiradiatum)对比,探究其避难所种群的遗传多样性及单倍型特征,共包含5个相关文件。
文件详解
- 单倍型数据文件(.nex格式)
- 文件名称:longi-hap.nex、eupho-hap.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:分别存储长辐射柴胡和柴胡的单倍型数据,用于种群遗传结构的系统发育分析
- 序列比对文件(.meg格式)
- 文件名称:Concatenated_alignments_(modified).meg
- 文件格式:MEG
- 字段映射介绍:包含修改后的序列拼接比对数据,支持遗传序列的多序列比对分析
- 种群数据文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Bupleurum_euphorbioides.xlsx、B.longiradiatum.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分别存储柴胡和长辐射柴胡的种群相关数据,可能包含样本信息、遗传标记数据等用于种群遗传分析的基础信息
数据来源
论文“Rear-edge, low-diversity, and haplotypic uniformity in cold-adapted Bupleurum euphorbioides interglacial refugia populations”
适用场景
- 植物避难所种群遗传多样性研究: 分析冷适应植物在冰期避难所的遗传多样性水平及单倍型特征
- 温带与冷适应植物遗传对比分析: 对比典型温带植物与冷适应植物的遗传结构差异,探究环境适应性的遗传机制
- 植物种群遗传结构分析: 利用微卫星和叶绿体DNA数据解析种群的遗传分化及基因流模式
- 气候变化下植物适应性研究: 基于避难所种群的遗传特征,预测植物对未来气候变化的适应潜力