布氏锥虫血液期蛋白定位标记数据集

数据集概述

本数据集记录了针对布氏锥虫血液期的靶向亚细胞蛋白定位标记研究数据,包含基因标记的定位注释、引物序列、基因选择标准及显微镜数据的DOI索引,为相关生物学研究提供基础数据支持。

文件详解

该数据集包含以下文件: - localisations.tsv:制表符分隔表,含每个标记基因的定位注释、引物序列及96孔板信息,每行对应一个基因ID,含N端和C端标记的列组 - geneselection.tsv:制表符分隔表,记录基因选择标准,包括利什曼原虫/克氏锥虫同源物存在情况、前循环期标记定位及信号强度、mRNA水平上调情况 - id_doi_index.tsv:制表符分隔表,列出布氏锥虫基因ID、标记尝试情况及对应显微镜数据的Zenodo DOI - plate_doi_index.tsv:制表符分隔表,列出所有96孔板及对应数据的Zenodo DOI - trypTag_BSF_master.zip:压缩文件,含构建血液期标记数据库的内部代码 - readme.docx:Word文档,含数据访问及使用trypTag_BSF_master.zip重建数据库的说明 - localisation_ontology.json:JSON格式文件,可能与定位注释的本体相关

适用场景

  • 布氏锥虫生物学研究:分析血液期蛋白亚细胞定位特征
  • 寄生虫学研究:探究锥虫不同生命周期阶段的蛋白表达与定位差异
  • 分子生物学实验:参考基因标记的引物序列及实验设计
  • 生物信息学分析:整合多组学数据研究锥虫基因功能与调控机制
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.44 MiB
最后更新 2025年12月16日
创建于 2025年12月16日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。