数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了TG34品系gld-1(op236)I基因突变体成虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含行为特征文件、标准化数据文件等,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:gld-1 (op236)Ion food L_2012_03_15__10_35_1864_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的秀丽隐杆线虫行为特征数据
- 标准化数据文件:
- 文件名称:gld-1 (op236)Ion food L_2012_03_15__10_35_1864.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储符合WCON标准的线虫行为数据
- 核心数据文件:
- 文件名称:gld-1 (op236)Ion food L_2012_03_15__10_35_1864.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的原始追踪数据及处理结果,包含25041个分段骨架数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析gld-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析:基于追踪数据研究线虫的运动模式、趋性等行为特征
- 生物信息学方法验证:用于测试和优化线虫行为追踪软件的算法性能
- 发育生物学研究:探究gld-1基因在秀丽隐杆线虫成虫阶段的功能作用