数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2246品系(egl-43(n1079)II基因突变体)成虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频特征、行为参数等数据文件,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food LR_2010_07_09__11_05_4082_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的特征数据,包含19380个分割骨架信息,对应实验过程中线虫的运动形态特征
- 行为数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food LR_2010_07_09__11_05_4082.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心行为数据,涵盖总时长(899.34秒)、帧率(25.641帧/秒)、像素微米比(4.52963微米/像素)等基础参数
- 压缩行为数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food LR_2010_07_09__11_05_4082.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的行为数据文件,包含线虫行为轨迹相关的结构化数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析egl-43基因突变体的运动模式、行为特征与野生型的差异
- 基因功能验证:探究egl-43基因在调控秀丽隐杆线虫行为中的作用机制
- 模式生物实验方法参考:为秀丽隐杆线虫行为实验的设计、数据采集与分析提供标准化流程参考
- 生物信息学数据挖掘:基于HDF5文件中的行为特征数据,挖掘线虫行为与基因表达的关联规律