数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB687品系(携带snf-5(ok447)II基因突变)的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于研究snf-5基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:snf-5 (ok447)II on food L_2009_11_18__15_10310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的原始或基础行为数据,为科学数据标准格式
- 文件名称:snf-5 (ok447)II on food L_2009_11_18__15_10310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 文件名称:snf-5 (ok447)II on food L_2009_11_18__15_10310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件(wcon格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析snf-5基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 线虫行为学分析: 基于视频及特征数据研究突变体线虫的觅食、移动等行为模式
- 模式生物实验方法验证: 参考E. Yemini等提出的实验方法,开展同类线虫行为实验
- 生物信息学数据挖掘: 利用标准化行为特征数据,构建线虫行为与基因关联模型