数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT15434菌株(携带tph-1(mg280)II突变)的行为实验数据。实验于2009年12月15日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为视频分析结果,涉及基因、菌株、实验条件及行为特征等核心信息。
文件详解
- 行为坐标数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food L_2009_12_15__11_43_3385.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的坐标数据,具体字段需解压后查看wcon格式内容
- 行为特征数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food L_2009_12_15__11_43_3385_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动轨迹、体态变化等量化指标
- 原始分析数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food L_2009_12_15__11_43_3385.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的原始分析数据,支持行为特征的溯源与二次分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析tph-1基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证血清素合成相关基因与线虫行为的关联机制
- 行为学实验方法优化: 参考实验方案(如30分钟适应期)改进线虫行为学实验设计
- 生物信息学工具测试: 利用HDF5格式的行为数据测试tierpsy等行为分析软件的性能