数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了gpa-14(pk347)I品系成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据。实验由MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪原始数据及行为特征分析结果,用于研究gpa-14基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
gpa-14 (pk347)I on food L_2010_02_25__14_58_56___1___13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,可能包含实验相关的元数据或补充信息
- 文件名称:
gpa-14 (pk347)I on food L_2010_02_25__14_58_56___1___13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征数据文件,存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征参数
- 文件名称:
gpa-14 (pk347)I on food L_2010_02_25__14_58_56___1___13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:视频追踪原始数据文件,包含19917个分割骨架数据,对应899.167秒实验时长、每秒25.974帧的视频分辨率(4.29558微米/像素)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-14基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析: 利用tierpsy提取的行为特征,研究线虫在食物环境中的行为模式
- 神经生物学机制探索: 结合基因背景与行为数据,探究gpa-14介导的神经信号通路
- 生物信息学算法验证: 用于行为追踪软件(如tierpsy)的算法性能验证与优化
- 实验方法标准化研究: 参考实验 protocol(E. Yemini et al. 方法)开展同类线虫行为实验