数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库,记录了RB1374品系(ocr-3(ok1559)X基因突变)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为实验数据,包含视频跟踪原始数据、特征提取结果等,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_23__12_41_21__9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始数据压缩文件,具体内容需解压后查看
- 行为跟踪数据文件
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_23__12_41_21__9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为跟踪的核心数据,包含19698个分割骨架等信息
- 行为特征数据文件
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_23__12_41_21__9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,实验总时长898.663秒,帧率31.5457帧/秒,视频像素对应4.3011微米
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变功能研究: 分析ocr-3(ok1559)X基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学行为分析: 基于跟踪数据和特征数据研究线虫的运动行为、觅食行为等神经调控机制
- 模式生物实验方法验证: 参考实验方案(Yemini et al.方法)和tierpsy软件使用流程,优化线虫行为实验设计
- 生物信息学特征提取: 基于HDF5文件中的骨架数据和特征数据,开发或验证线虫行为特征提取算法