数据集概述
本数据集为草地贪夜蛾两种宿主品系转录差异研究的配套数据与脚本，包含产卵实验、互惠移植实验的原始数据，以及用于数据分析的R脚本、bash脚本和补充说明文档，支持复现相关实验结果与差异表达分析。
文件详解
- 数据文件：
- Data_Ovip.txt：TXT格式，存储产卵实验数据，包含品系、条件、产卵数等字段
- Data_RT.csv：CSV格式，存储互惠移植实验非存活数据，包含日期、品系、植物类型、幼虫阶段等字段
- Data_RT_Survival.csv：CSV格式，存储互惠移植实验存活数据，包含实验模式、初始数量、存活率等字段
- 分析脚本：
- script_OvipoExperiment.R：R脚本，用于分析产卵实验记录的生活史性状
- script_RTexperiment.R：R脚本，用于分析互惠移植实验记录的生活史性状
- MORT_align.sh：bash脚本，实现从基因组参考序列比对到读取计数阵列生成的流程
- MORT_DESeq2.Analysis.R：R脚本，使用DESeq2进行读取计数数据的差异表达分析
- 补充文档：
- Supporting_Information.pdf：PDF格式，提供研究相关的补充说明信息
数据来源
Orsucci et al. (2020)发表于PCI Evol Biol的研究（doi: 10.24072/pci.evolbiol.100102）
适用场景
- 昆虫学研究：分析草地贪夜蛾不同宿主品系的生活史性状差异
- 分子生物学研究：复现草地贪夜蛾宿主品系间的转录组差异表达分析
- 实验数据复现：验证产卵实验与互惠移植实验的结果
- 生物信息学方法参考：学习基于DESeq2的差异表达分析流程及基因组比对脚本编写
- 生态学研究：探究草地贪夜蛾宿主适应性相关的表型与分子机制
