数据集概述
本数据集包含非洲长指蛙属（Cardioglossa）18个物种的系统发育分析相关文件，基于线粒体和核基因位点数据构建。涵盖系统发育树、分区方案、物种界定分析等结果，支持研究该属物种的分化时间、生物地理历史及体色分化机制，共8个文件。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre）
- 文件名称：05_Cardioglossa_BEAST_Nucs12S16S_Con.tre、03_Cardioglossa_MrBayes_AllDataPart.con.tre、02_Cardioglossa_RAxML_AllDataPart.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：包含不同方法（BEAST、MrBayes、RAxML）构建的系统发育树结果，记录物种间的进化关系与分化时间
- 分区方案与配置文件（.txt、.nex）
- 文件名称：01b_Cardioglossa_RAxML_AllData_PartFile.txt、Cardioglossa_PartitionFinder_best_scheme.txt、01c_Cardioglossa_MrBayes_AllData_wPartitionBlock.nex
- 文件格式：TXT、NEX
- 字段映射介绍：记录基因序列的分区方案（如Subset1-Subset4对应的序列位置）、PartitionFinder最优分区方案及MrBayes分析的分区配置
- 序列数据文件（.phy）
- 文件名称：01a_Cardioglossa_RAxML_AllData.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：包含用于系统发育分析的所有基因序列数据
- 采样信息表（.xlsx）
- 文件名称：TableS1_Sampling_v3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录采样物种的样本信息，支持系统发育分析的样本溯源
数据来源
论文“Phylogeny of African long-fingered frogs (Arthroleptidae: Cardioglossa) reveals recent allopatric divergences in coloration”
适用场景
- 两栖动物系统发育研究：分析Cardioglossa属物种的进化关系与分化时间
- 生物地理历史重建：基于系统发育树探究该属物种的地理分布格局形成机制
- 物种界定与分类修订：支持C. manengouba、C. oreas等物种的分类地位验证
- 体色分化机制研究：分析近缘异域种群体色差异的进化意义与驱动因素
- 遗传数据分区方法优化：参考PartitionFinder最优分区方案，提升系统发育分析准确性
