CaVβ与肌动蛋白相互作用表面映射及钙通道清除作用HADDOCK对接数据集

数据集概述

本数据集包含HADDOCK蛋白质-蛋白质对接数据,用于构建CaVβ与F-肌动蛋白复合物模型,核心围绕两者相互作用表面映射及钙通道清除作用展开,为相关分子机制研究提供数据支持。

文件详解

该数据集为压缩文件,内部包含四个子文件夹,具体说明如下: - 压缩文件: Cavbeta-Actin_Docking.zip,ZIP格式,包含所有子文件夹及数据文件 - 子文件夹内容: - Cavbeta2文件夹: 含二聚体肌动蛋白(PDB 5OOE)与CaVβ2(PDB 5V2P)对接数据 - 输入文件: job_params.json(运行参数)、unambig.tbl(XL/MS明确距离约束)、ambig.tbl(CPORT/NACCESS模糊距离约束) - 输出文件: cluster1_1.pdb至cluster1_4.pdb(前4个聚类模型)、补充图表源数据 - Cavbeta4文件夹: 含二聚体肌动蛋白(PDB 5OOE)与CaVβ4(PDB 1VYV)对接数据,文件结构同Cavbeta2文件夹 - Monomer文件夹: 含单体肌动蛋白(PDB 5OOE)与CaVβ2(PDB 5V2P)对照对接数据,文件结构同Cavbeta2文件夹 - Ab_initio文件夹: 含无XL-MS约束的二聚体肌动蛋白与CaVβ2从头对接数据 - 输入文件: job_params.json(6组对照模拟参数) - 输出文件: 补充表6源数据、补充图5模型文件

适用场景

  • 分子生物学研究: 分析CaVβ与肌动蛋白的相互作用机制
  • 结构生物学分析: 构建和验证蛋白质复合物三维结构模型
  • 钙通道功能研究: 探究CaVβ-肌动蛋白相互作用对钙通道清除的影响
  • 计算生物学应用: 作为HADDOCK对接方法的验证数据集或参数优化参考
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.55 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。