数据集概述
本数据集包含产β-内酰胺前体δ-(L-α-氨基己二酰)-L-半胱氨酰-D-缬氨酸(ACV)的代谢工程毕赤酵母(Komagataella phaffii)全基因组序列数据,支持相关代谢工程研究论文,采用Illumina和Nanopore混合平台测序。
文件详解
- 目录: Whole Genome Sequence of Metabolically Engineered/
- 文件1: WGS Pichia pastoris_ACV.fasta,格式为FASTA,包含代谢工程毕赤酵母ACV菌株的全基因组序列
- 文件2: NCBI BLAST_npgA gene.txt,格式为TXT,包含npgA基因与毕赤酵母ACV菌株全基因组序列的NCBI BLAST比对结果
- 文件3: NCBI BLAST_pcbAB gene.txt,格式为TXT,包含pcbAB基因与毕赤酵母ACV菌株全基因组序列的NCBI BLAST比对结果
适用场景
- 微生物代谢工程研究: 分析产ACV毕赤酵母菌株的基因组特征与代谢通路
- 基因功能验证: 基于BLAST结果研究pcbAB和npgA基因在毕赤酵母中的定位与功能
- 合成生物学应用: 为β-内酰胺类化合物生物合成的菌株优化提供基因组数据支持
- 分子生物学实验: 作为毕赤酵母基因编辑与表达调控研究的参考序列资源