数据集概述
本数据集为澳大利亚淡水龟Chelodina expansa的线粒体系统地理学研究数据，包含两种线粒体基因座的测序结果、基因谱系网络、分子方差分析及种群历史分析相关文件，用于探究该龟种内陆与沿海生物区系间的遗传分化关系，共含3个文件。
文件详解
- Network_CE_n164_variablesites_gapsexcluded.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含164个样本的可变位点且排除间隙的序列数据，用于构建基因谱系网络
- Arlequin_CE_haps_by_catchment.arp
- 文件格式：ARP
- 字段映射介绍：按流域划分的单倍型数据文件，用于分子方差分析（AMOVA）
- BEAST_CE_haps.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：单倍型数据的XML元数据文件，用于BEAST软件进行种群历史分析
数据来源
论文“Phylogeography of the Australian freshwater turtle Chelodina expansa reveals complex relationships among inland and coastal bioregions”
适用场景
- 淡水龟种遗传分化研究: 分析Chelodina expansa内陆与沿海种群的线粒体基因分化程度
- 生物地理屏障识别: 探究隐存系统地理屏障对淡水生物遗传结构的影响机制
- 种群历史动态分析: 利用中性检验、扩张指数及错配分析评估种群演化历史
- 淡水生物保护策略制定: 辅助识别隐存微生物地理区系，为淡水生物保护提供遗传依据
