数据集概述
本数据集为莱茵衣藻共表达网络研究的补充数据，包含基于518个转录组样本构建的基因共表达关系数据，涉及纤毛、细胞分裂、光合作用等通路的高置信度基因集，同时揭示了批量培养中显著的转录组节律性。数据集共23个文件，支持基因功能发现与相关通路分析。
文件详解
- Excel数据文件（Supplemental Data Set）
- 文件名称：遵循
TPC2020-RA-00822R1_Supplemental_Data_Set_[编号].xlsx模式（如Set_1、Set_3、Set_5等）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含转录组样本的基因表达量数据、共表达基因集、通路相关基因列表等结构化数据，支持基因功能注释与通路分析。
- 文本文件（Supplemental File）
- 文件名称：遵循
TPC2020-RA-00822R1_Supplemental_File_[编号].txt模式（如File_1、File_2等）
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含基因共表达关系的原始数据，如基因ID对及其相关系数（如Cre01.g000017与Cre01.g017701的相关系数0.8187），用于直接解析基因间的共表达与反相关关系。
- 协议压缩文件
- 文件名称：Protocols.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含跨转录组数据集进行共表达分析的分步实验方案，适用于莱茵衣藻及其他物种的基因功能发现研究。
数据来源
论文“Co-expression networks in Chlamydomonas reveal significant rhythmicity in batch cultures and empower gene function discovery”
适用场景
- 藻类基因功能注释：利用共表达网络数据预测莱茵衣藻未知基因的功能，关联至特定细胞通路。
- 转录组节律性研究：分析批量培养中莱茵衣藻转录组的残留同步性，探究节律对基因表达的影响。
- 细胞通路机制分析：针对纤毛、光合作用、脂质代谢等通路，挖掘关键基因间的共表达关系。
- 分子生物学实验方案参考：基于压缩包内的分步协议，开展其他物种的转录组共表达分析。
- 藻类代谢工程研究：通过共表达网络识别代谢通路关键基因，为藻类生物合成优化提供靶点。
