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EPFL_Based大肠杆菌复杂化学品生物合成路径设计数据集
2026年1月29日 30 177 70
数据集概述 本数据集包含大肠杆菌生物合成70种复杂化学品的路径设计结果，涵盖相关模型与子网络信息，为生物工程领域研究提供结构化参考，支持复杂化学品生物合成路径的分析与优化。 文件详解 文件名称：EPFL.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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ARBRE_Source_芳香化合物生物合成路径预测补充数据集
2026年1月29日 30 184 171
数据集概述 本数据集是论文“ARBRE: Computational resource to predict pathways towards industrially important aromatic...
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GAL3_Based_酵母糖偏好分化机制研究实验数据
2026年1月31日 30 200 141
数据集概述 本数据集围绕酵母对葡萄糖和半乳糖两种替代糖底物的偏好分化机制展开，通过量化GAL1基因的剂量依赖性诱导，探究不同酵母物种及生态分离株的代谢策略差异，重点分析Gal3传感器表达与活性调节对糖利用偏好的影响，共包含33个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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ambr250_Based海洋木霉T2菌株产粘酸培养数据
2026年1月30日 30 124 14
数据集概述 本数据集包含海洋木霉Trichoderma sp. VTT D-221704（曾用名T2）及里氏木霉Trichoderma reesei D-161646在ambr250自动化微生物反应器中，以葡萄糖和D-半乳糖醛酸为培养基的补料分批培养数据，以及2升、1升和250升生物反应器培养的二氧化碳数据，共3个文件，均为Excel格式。 文件详解...
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Galaxy_Synbiocad_路径评估多指标排序训练数据
2026年1月29日 30 91 20
数据集概述 本数据集为Galaxy路径分析工作流训练教程提供输入数据，包含待排序的异源路径SBML文件及宿主生物大肠杆菌iML1515的基因组尺度代谢模型SBML文件，用于通过目标产物通量、热力学可行性等四个标准评估预测路径性能，生成评分排序后的路径集合。 文件详解 SBML格式路径文件...
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H_desertis_G11_nEPS合成基因标准曲线与表格数据
2026年1月28日 30 172 93
数据集概述 本数据集包含H desertis G11菌株中与nEPS（中性胞外多糖）合成相关的基因信息及标准曲线数据，核心为一份文档文件，记录了相关基因的分子生物学分析基础数据，可用于微生物nEPS合成机制的研究。 文件详解 文件名称：Standard curves and table of genes implicated in EPS...
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Shewanella_oneidensis电子摄取通路识别研究数据
2026年1月27日 30 202 144
数据集概述 本数据集是论文“Identification of a Pathway for Electron Uptake in Shewanella oneidensis”的配图数据，包含8个Excel文件，对应论文中的主图和补充图数据，用于支撑Shewanella oneidensis电子摄取通路的识别研究，涵盖基因筛选、电化学测试等实验结果。...
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AtoSC_Based_乙酰乙酸诱导型全细胞生物传感器工程数据_研究用
2026年1月26日 30 50 23
数据集概述 本数据集为论文配套的数据与代码压缩包，核心内容围绕基于AtoSC双组分系统构建的乙酰乙酸诱导型全细胞生物传感器展开，包含支撑该研究的相关数据与代码资源，总计1个压缩文件。 文件详解 文件名称：acac-zenodo.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含论文“Engineered acetoacetate-inducible...
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Chlamydomonas_衣藻共表达网络分析与基因功能发现补充数据
2026年1月23日 30 107 36
数据集概述 本数据集为莱茵衣藻共表达网络研究的补充数据，包含基于518个转录组样本构建的基因共表达关系数据，涉及纤毛、细胞分裂、光合作用等通路的高置信度基因集，同时揭示了批量培养中显著的转录组节律性。数据集共23个文件，支持基因功能发现与相关通路分析。 文件详解 Excel数据文件（Supplemental Data Set）...
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卡尔迪莫纳斯嗜热聚羟基烷酸酯生产菌基因组编辑工具集原始数据_2024
2026年1月23日 30 11 9
数据集概述 本数据集为论文“An initial genome editing toolset for Caldimonas thermodepolymerans, the first model of thermophilic polyhydroxyalkanoates...
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酿酒酵母_GAL80_gal80Δ_己糖激酶II耗竭_蛋白质组响应分析数据
2026年1月21日 30 209 61
数据集概述 本数据集记录了GAL80和gal80Δ基因型酿酒酵母在己糖激酶II（HXK2）耗竭后的蛋白质组响应分析结果，涉及添加1-萘乙酸条件下指数生长期和乙醇生长期的菌株对比，包含两组独立实验数据，共两个文件。 文件详解 Dataset 1：GAL80_HXK2_Vs._dhxk2p_20200324_T2_004.xlsx 文件格式：XLSX...
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Cupriavidus_necator_2_3_丁二醇自养生产实验结果数据
2026年1月21日 30 12 11
数据集概述 本数据集记录了利用Cupriavidus necator（C. necator）自养生产2,3-丁二醇（2,3-BD）的实验结果，包含不同异源表达酶的研究数据，以及计算得到的氢效率和碳产率。数据集仅含一个文件，无目录结构。 文件详解 文件名称：Autotroph results.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含C....
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Combined_SupplementaryData_酿酒酵母与大肠杆菌代谢模型数据
2026年1月18日 30 44 42
数据集概述 本数据集包含酿酒酵母（Supplementary Data 1）和大肠杆菌（Supplementary Data 2）的组合热力学与化学计量代谢模型数据，共2个文件，用于微生物代谢研究相关分析。 文件详解 SupplementaryData1.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含酿酒酵母的组合热力学与化学计量代谢模型相关数据...
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Machine_learning_Guided_酵母对香豆酸生产优化博士论文补充数据
2026年1月18日 30 100 17
数据集概述 本数据集为博士论文《Model-Guided Strain Engineering: Bridges between Design and Learning in Bioprocess Development》第9章的补充表格与数据，聚焦酵母中对香豆酸生产的机器学习引导优化研究，包含2个Excel格式文件，为生物工艺开发相关研究提供支持。...
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Supplementary_Carbon_negative_工业中试气体发酵丙酮异丙醇生产补充数据集
2026年1月5日 30 103 101
数据集概述 本数据集是论文“Carbon-negative production of acetone and isopropanol by gas fermentation at industrial pilot...
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Vidgren_et_al_2020_Based_海洋真菌D_半乳糖醛酸转化半乳糖二酸工程数据_2020
2026年1月1日 30 80 44
数据集概述 本数据集记录了两种海洋真菌（Trichoderma sp. LF328和Coniochaeta sp. MF729）经工程改造后，从D-半乳糖醛酸生产半乳糖二酸的实验数据，包含24孔板培养和生物反应器培养两类HPLC检测数据，支撑海洋微生物代谢工程研究。 文件详解 24孔板培养HPLC数据...
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Saccharomyces_cerevisiae_Based_酿酒酵母生产对香豆酸的途径工艺培养基组合优化数据
2025年12月28日 30 39 35
数据集概述 本数据集围绕酿酒酵母生产对香豆酸的组合优化展开，包含途径、工艺及培养基相关的补充表格信息，为微生物发酵生产对香豆酸的研究提供结构化参考数据，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：Supplementary tables.xlsx 文件格式：XLSX...
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pISA_tree_SUSPHIRE_T0代LPPS和CPPS转基因本氏烟草单萜类产物的HSPME_GCMS分析原始数据
2025年12月27日 30 111 41
数据集概述 本数据集记录T0代转LPPS或CPPS基因本氏烟草植株的单萜类产物分析结果，通过HSPME技术检测薰衣草醇、菊醇等单萜类衍生物的生成情况，为第二轮移栽至土壤的转基因植株代谢产物研究提供原始数据支持。 文件详解 文件名称：_A_T0NbenthLPPSCPPS2ndround-GCMS.output.raw.Zenodo.zip...
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酿酒酵母基因组尺度代谢模型数据集
2025年12月19日 30 140 10
数据集概述 该数据集包含复现O. Oftadeh等人关于酿酒酵母基因组尺度代谢模型研究结果所需的模型与数据，模型整合了表达约束和反应热力学信息，为相关代谢研究提供基础数据支持。 文件详解...
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灵芝细胞色素P450与酵母3_酮甾醇还原酶ERG27代谢灵芝酸研究菌株信息表
2025年12月24日 30 174 11
数据集概述 本数据集为灵芝细胞色素P450与酵母3-酮甾醇还原酶ERG27代谢灵芝酸研究中使用的菌株信息表，包含大肠杆菌和酿酒酵母两种菌株的来源、基因型及构建信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Strain: 菌株名称 Description: 菌株描述（基因型、载体信息等）...
