数据集概述
本数据集是论文“Carbon-negative production of acetone and isopropanol by gas fermentation at industrial pilot scale”的补充数据，包含10个补充表格，覆盖基因挖掘、组合文库构建、基因敲除预测、无细胞原型设计、蛋白质组学分析、基因组登录号、寡核苷酸序列及生命周期评估相关排放因子等内容，为工业中试规模气体发酵生产碳负性丙酮和异丙醇的研究提供支撑。
文件详解
- 文件名称：Supplementary_Data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含10个补充表格，具体为：
- Supplementary Tab.1：DJ集合挖掘的丙酮生物合成基因、组合文库及无细胞原型设计使用的基因和元件序列
- Supplementary Tab.2：组合文库组合及实验结果
- Supplementary Tab.3：基因敲除（KO）预测结果
- Supplementary Tab.4：无细胞原型设计组合及实验结果
- Supplementary Tab.5：野生型菌株加丙酮生物合成质粒的蛋白质组学结果
- Supplementary Tab.6：Δ0553菌株加选定组合文库质粒的蛋白质组学结果
- Supplementary Tab.7：272个基因组的Genbank登录号
- Supplementary Tab.8：寡核苷酸序列
- Supplementary Tab.9：生命周期评估（LCA）中丙酮温室气体排放因子
- Supplementary Tab.10：生命周期评估（LCA）中异丙醇（IPA）温室气体排放因子
数据来源
论文“Carbon-negative production of acetone and isopropanol by gas fermentation at industrial pilot scale”
适用场景
- 生物合成基因挖掘研究：利用补充表1的基因序列数据，分析丙酮生物合成相关基因的功能及应用潜力
- 工业菌株改造优化：通过组合文库（表2）、基因敲除预测（表3）数据，指导工业发酵菌株的代谢工程改造
- 无细胞系统原型设计：基于表4的无细胞原型设计结果，优化碳负性丙酮异丙醇的体外合成体系
- 蛋白质组学分析：利用表5、表6的蛋白质组学数据，研究菌株发酵过程中的蛋白表达变化及调控机制
- 生命周期评估研究：通过表9、表10的排放因子数据，开展丙酮和异丙醇生产的碳足迹计算与环境影响分析
