数据集概述
本数据集围绕乳腺癌内分泌治疗耐药性的克隆异质性展开，通过对敏感细胞系（MCF7、T47D）进行条形码标记并诱导耐药，分离单克隆细胞系后开展RNA-Seq和磷酸化蛋白质组学分析。包含8个文件，涵盖条形码标记信息、基因表达数据及整合位点分析等内容，用于研究耐药克隆的分子特征。
文件详解
- 文本文件（TXT）
- 文件名称：Supplementary File 3_all_barcodes_seqq_table_T47D_labelled.txt、Supplementary File 2_all_barcodes_seqq_table_MCF7_labelled.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含"barcode_sequence"（条形码序列）及对应的标记样本编号（如AS.340958.LR.42266）等字段，记录耐药细胞系的条形码标记信息。
- 表格文件（XLSX）
- 文件名称：Supplementary File 5_T47D_200 most variable genes.xlsx、Supplementary File 1_Barcodes_and_labeling_overview.xlsx、MCF7_TAMR_MiSeq_all_barcodes_gr10.xlsx、Supplementary File 4_MCF7_200 most variable genes.xlsx、MCF7_LTED_MiSeq_all_barcodes_gr10.xlsx、Integration site analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：涵盖条形码标记概述、MCF7/T47D细胞系的高变基因列表、耐药细胞克隆的条形码测序数据及整合位点分析结果等内容。
适用场景
- 乳腺癌耐药机制研究: 分析内分泌治疗耐药克隆的基因表达和磷酸化修饰特征，探究耐药异质性机制。
- 肿瘤克隆进化分析: 通过条形码标记追踪耐药克隆的起源与演化过程。
- 分子标志物筛选: 基于高变基因数据识别耐药相关的潜在分子标志物。
- 肿瘤精准治疗研究: 为乳腺癌内分泌治疗耐药的个体化干预策略提供数据支持。
