数据集概述
本数据集提供了用于执行西班牙国家心血管研究中心(CNIC)心血管蛋白质组学实验室/蛋白质组学单元开发的多种Nextflow流程的输入样本文件,重点支持nf-PTM-compass流程对翻译后修饰(PTMs)的识别与定量分析。
文件详解
- 文件名称:heteroplasmic_heart.zip,文件格式:.zip
- 内容:心脏组织样本输入文件,用于nf-PTM-compass流程,数据来源于Bagwan N等人2018年的研究,包含通过nf-SearchEngine进行开放搜索的结果
- 文件名称:heteroplasmic_liver.zip,文件格式:.zip
- 内容:肝脏组织样本输入文件,用于nf-PTM-compass流程,数据来源于同一研究,包含通过nf-SearchEngine进行开放搜索的结果
- 文件名称:heteroplasmic_muscle.zip,文件格式:.zip
- 内容:肌肉组织样本输入文件,用于nf-PTM-compass流程,数据来源于同一研究,包含通过nf-SearchEngine进行开放搜索的结果
数据来源
西班牙国家心血管研究中心(CNIC)心血管蛋白质组学实验室/蛋白质组学单元
适用场景
- 蛋白质组学流程测试:用于验证和测试nf-PTM-compass等Nextflow流程的执行效果
- 翻译后修饰分析:支持基于开放搜索结果的蛋白质翻译后修饰(PTMs)识别与定量研究
- 跨组织蛋白质组学研究:为心脏、肝脏、肌肉等不同组织的蛋白质修饰分析提供标准化输入样本
- 生物信息学方法验证:作为基准数据验证蛋白质组学分析流程的准确性和稳定性