数据集概述
本数据集包含七株环境来源细菌分离株的比较基因组学分析结果,涉及芳香族化合物、异生物质降解能力及重金属抗性的注释与分析数据。共12个文件,涵盖基因组注释压缩包、BacMet2分析压缩包及基因计数、抗性蛋白统计表格,为环境微生物功能研究提供基础数据。
文件详解
- 基因组注释文件(RASTtk Annotation)
- 文件名称:P.stutzeri_ODKF13_RASTtk_Annotation.zip、S.maltophilia_CBF10-1_RASTtk_Annotation.zip、O.anthropi_FRAF13_RASTtk_Annotation.zip、A.xylosoxidans_ADAF13_RASTtk_Annotation.zip、R.radiobacter_GHKF11_RASTtk_Annotation.zip、Exiguobacterium_sp_KKBO11_RASTtk_Annotation.zip(共6个菌株注释文件)
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含各菌株基因组的RASTtk注释结果,推测涵盖基因功能注释、编码序列预测等基因组特征信息
- BacMet2分析文件
- 文件名称:BacMet2_Analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:推测包含基于BacMet2数据库的细菌重金属抗性相关分析结果
- 基因计数表格
- 文件名称:KEGG_gene_counts.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含各菌株KEGG通路相关基因的计数统计信息
- 重金属抗性蛋白表格
- 文件名称:Heavy_Metal_Resistance_Proteins.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含各菌株重金属抗性相关蛋白的统计信息
适用场景
- 环境微生物功能基因组学研究:分析七株细菌分离株的基因组特征与功能潜力
- 污染物降解机制研究:探究细菌对芳香族化合物、异生物质的降解相关基因与通路
- 重金属抗性机制分析:基于BacMet2分析结果及抗性蛋白表格,研究细菌重金属抗性的分子基础
- 环境微生物资源筛选:为筛选具有污染物降解或重金属抗性的功能微生物提供数据支持