数据集概述
本数据集是关于美国鼠兔(Ochotona princeps)的保护基因组学研究成果,通过对非侵入性采集的毛发样本进行基因分型测序,在两个海拔样带上的8个位点识别并分型了3803个高置信度单核苷酸多态性(SNPs),同时检测出55个受选择的候选基因区域。数据揭示了基因多样性与海拔的正相关关系及低海拔种群的近交现象,包含1个文件。
文件详解
- 文件名称:
PikaNextRAD_SNP.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:预计包含美国鼠兔非侵入性样本的基因组学分析结果,可能涵盖位点信息(如8个采样位点的地理与海拔数据)、SNP分型数据(3803个高置信度SNPs的基因分型信息)、受选择候选位点(55个离群位点的标识及相关基因区域)、基因多样性指标(不同海拔位点的基因多样性、杂合度等统计数据)等核心研究数据。
数据来源
论文“From promise to practice: pairing non-invasive sampling with genomics in conservation”
适用场景
- 保护基因组学方法验证: 评估非侵入性采样与二代测序技术结合在濒危物种基因组研究中的可行性与技术优化方向。
- 物种适应性进化研究: 利用55个受选择候选基因区域,分析美国鼠兔对气候环境(如海拔梯度)的适应性进化机制。
- 种群遗传学分析: 通过基因多样性、杂合度等数据,研究美国鼠兔种群结构、近交程度及海拔对种群遗传的影响。
- 生态保护策略制定: 基于不同海拔种群的遗传特征,为气候变化敏感物种(如美国鼠兔)的保护优先级划分和栖息地管理提供基因组学依据。