数据集概述
本数据集是谷氨酸棒杆菌的基因表达谱汇编,包含927个手动整理的基于微阵列的转录谱,覆盖野生型和工程菌株在不同环境条件或基因修饰下的3047个注释基因表达变化。数据已整合为304个微阵列集,分为六类用于差异基因表达分析,是研究该工业氨基酸生产模式微生物转录调控的资源。
文件详解
- 文件名称:Filtered differential expression results.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含经过筛选的差异基因表达分析结果,具体字段未提供预览,推测涵盖基因ID、差异表达倍数、统计显著性等差异分析核心指标
- 文件名称:Normalized expression matrix_fluorescence intensities.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含标准化处理后的基因表达矩阵,以荧光强度为量化指标,推测涵盖基因ID、样本ID及对应标准化表达值等字段
适用场景
- 谷氨酸棒杆菌转录调控研究: 分析野生型与工程菌株在不同条件下的基因表达模式,解析转录调控机制
- 工业菌株优化: 基于差异表达结果识别关键功能基因,指导氨基酸高产菌株的理性构建
- 环境响应机制分析: 探究菌株对不同环境条件的基因表达响应,揭示适应性代谢通路
- 微生物系统生物学研究: 整合表达谱数据构建基因调控网络,助力系统理解细胞工厂的代谢机制