数据集概述
本数据集围绕华丽龙蜥(Ctenophorus ornatus)展开,包含其在未受干扰保护区与农业改造栖息地中的寄生虫负荷(蜱虫数量)、MHC基因多样性及相关基因型、功能等位基因与表达数据,用于研究宿主-寄生虫协同进化对MHC多态性的影响,以及栖息地类型对该关系的作用。
文件详解
- 文件名称:Ctenophorus_ornatus_tick_load_n_MHC_alleles.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含华丽龙蜥的蜱虫数量(寄生虫负荷代理指标)与MHC等位基因数量关联数据
- 文件名称:Ctenophorus_ornatus_MHC_msat_genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录华丽龙蜥MHC微卫星基因型数据
- 文件名称:Ctenophorus_ornatus_MHC_I_putative_functional_alleles.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:存储华丽龙蜥MHC I类推定功能等位基因序列
- 文件名称:Ctenophorus_ornatus_expression_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含华丽龙蜥相关基因表达数据
数据来源
论文“Parasite load and MHC diversity in undisturbed and agriculturally modified habitats of the ornate dragon lizard”
适用场景
- 宿主-寄生虫协同进化研究: 分析MHC基因多态性与蜱虫负荷的关联,验证宿主-寄生虫协同进化对MHC多样性的驱动作用
- 栖息地干扰生态效应评估: 对比未受干扰保护区与农业改造栖息地中MHC多样性与寄生虫负荷关系的差异
- 种群遗传学研究: 利用MHC微卫星基因型数据探究种群遗传结构与中性多样性的关联
- 功能基因组学分析: 通过MHC I类功能等位基因序列与表达数据,研究基因功能与表型的关系