数据集概述
本数据集记录了大豆静脉坏死病毒(SVNV)的种子传播实验研究,包含RT-PCR检测、RNA-seq分析及相关实验结果,验证了该病毒可通过种子传播至幼苗,传播率为百分之六,是首个被证实种子传播的番茄斑萎病毒属病毒。
文件详解
该数据集包含11个文件,涵盖实验数据、分析结果及序列文档,具体说明如下:
- 实验结果与图表文件(PDF格式):
- 150701J2_07E_2-27-2M-1.pdf:可能为实验过程记录或原始数据图表
- Bulk_MappedCounts.pdf、Bulk_MappedCounts_Unique.pdf:批量样本的基因映射计数图表
- Field_Fig2A_MappedCounts.pdf、Field_Fig2B_MappedCounts_Unique.pdf:田间样本的基因映射计数图表
- 序列与文档文件(DOCX格式):
- Sequences_PlosOne.docx、Sequences of nested PCR products-SVNV-06302015.docx:病毒序列文档
- Alignment-BAST-SVNV.docx:序列比对分析文档
- R10_Root_SVNV-seq.docx:根系样本测序分析文档
- 原始数据文件(XLSX格式):
- Raw Gene Count Data_RNAseq.xlsx:RNA-seq原始基因计数数据
- 分析代码与数据文件(RTF格式):
- Seed Quality Raw data and Analysis code.rtf:种子质量原始数据及分析代码
适用场景
- 植物病毒学研究:分析大豆静脉坏死病毒的种子传播机制
- 农业病害防控:研究作物种子带毒检测及风险评估方法
- 分子生物学实验:验证RT-PCR与RNA-seq技术在病毒检测中的应用
- 植物病理学分析:探索番茄斑萎病毒属病毒的传播途径及防控策略