数据集概述
本数据集围绕代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用展开，包含基因敲除、药物抑制实验及单细胞测序等相关数据，支撑GRM4靶向作为癌症免疫治疗新策略的研究结论。
文件详解
- 差异表达基因数据文件：
- DEG_190406.csv（CSV格式）：包含基因ID、基因名称、不同样本（KO_CD45、WT_CD45、KO_Tumor、WT_Tumor）的表达量、差异表达状态、log2倍变化、统计检验值等字段
- TCR测序相关文件：
- 2020Nov17.8x24_KO-TCR.metrics_summary.csv（CSV格式）：TCR测序数据的指标汇总
- 2020Nov17.8x24_WT-TCR.all_contig.fastq（FASTQ格式）：野生型样本TCR的所有contig序列
- 2020Nov17.8x24_KO-TCR.consensus_annotations.csv（CSV格式）：敲除型样本TCR的共识序列注释，包含barcode、细胞状态、contig ID、基因链、CDR3序列等字段
- 2020Nov17.8x24_KO-TCR.filtered_contig.fastq（FASTQ格式）：敲除型样本过滤后的contig序列
- 2020Nov17.8x24_WT-TCR.web_summary.html（HTML格式）：野生型样本TCR测序的网页版总结报告
- 2020Nov17.8x24_KO-TCR.airr_rearrangement.tsv（TSV格式）：敲除型样本TCR重排的AIRR格式数据
- 2020Nov17.8x24_WT-TCR.concat_ref.fasta（FASTA格式）：野生型样本TCR的参考序列拼接文件
适用场景
- 癌症免疫治疗靶点研究：分析GRM4对肿瘤微环境免疫细胞的调控机制
- 免疫细胞表型研究：探究GRM4缺失对NK细胞、CD4+及CD8+ T细胞活化增殖的影响
- 单细胞测序数据分析：研究CD8+ T细胞的克隆扩增及免疫景观变化
- 临床预后标志物研究：验证NKhigh-GRM4low、CD8high-GRM4low特征与黑色素瘤患者生存的相关性
