大菱鲆转录组_RNA_seq感染与对照组头肾脾脏幽门盲囊数据集24天

数据集概述

本数据集包含感染肠粘孢子虫24天后及对照组大菱鲆的头肾、脾脏、幽门盲囊三个组织的RNA-seq转录组数据,通过TopHat2比对基因组、Cufflinks生成转录组,提供基因序列及注释信息。

文件详解

  • 主目录:Scophthalmus maximus transcriptome - RNA-seq head kidney, spleen and pyloric caeca - 24 days post infection Enteromyxum infected and control turbot/
  • merged-immune2-genes.fasta:FASTA格式,包含合并后的免疫相关基因序列
  • immune2-annotation.txt:TXT格式,注释文件,字段包括Sequence name、Sequence desc.、Sequence length、Hit desc.、Hit ACC、E-Value、Similarity、Bit-Score、Alignment length、Positives等

适用场景

  • 鱼类免疫学研究:分析大菱鲆感染肠粘孢子虫后的免疫基因表达变化
  • 比较转录组分析:探究感染组与对照组在头肾、脾脏、幽门盲囊组织中的基因差异表达
  • 功能基因组学:基于注释信息研究免疫相关基因的功能及分子机制
  • 水产病害防控:为大菱鲆抗肠粘孢子虫病的遗传育种提供基因靶点数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 26.37 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。