蛋白质二级结构预测数据集ProteinSecondaryStructurePredictionDataset-watle107
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质, 结构生物学, 二级结构, 序列分析, 机器学习, 蛋白质折叠, 数据挖掘, 生物信息学
数据概述:
该数据集包含来自蛋白质数据库的蛋白质二级结构相关数据,记录了蛋白质序列及其对应的二级结构信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态蛋白质结构快照。
地理范围:数据来源于蛋白质数据库,覆盖全球范围内的蛋白质结构。
数据维度:包括pdb_id(蛋白质数据库编号),chain_code(链代码),seq(氨基酸序列),sst8(8态二级结构),sst3(3态二级结构),len(序列长度),has_nonstd_aa(是否包含非标准氨基酸)等字段。
数据格式:CSV格式,文件名为protine.csv,便于进行结构分析和建模。
来源信息:数据来源于蛋白质数据库,经过提取和整理,用于蛋白质结构预测和分析。
该数据集适合用于蛋白质二级结构预测、蛋白质结构-功能关系研究以及相关生物信息学领域的机器学习模型构建。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于结构生物学、生物物理学、计算生物学等领域的学术研究,如蛋白质折叠、结构预测、蛋白质设计等。
行业应用:为生物制药、生物技术公司提供数据支持,用于蛋白质工程、药物设计、靶点识别等。
决策支持:支持蛋白质结构预测模型的开发和优化,助力科研人员更好地理解蛋白质功能。
教育和培训:作为生物信息学、结构生物学等相关课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质结构和功能。
此数据集特别适合用于探索蛋白质序列与二级结构之间的关系,以及构建和评估蛋白质结构预测模型,从而加速蛋白质研究和药物研发。