蛋白质N-糖基化位点预测数据集ProteinN-GlycosylationSitePredictionDataset-jsuszj

蛋白质N-糖基化位点预测数据集ProteinN-GlycosylationSitePredictionDataset-jsuszj

数据来源:互联网公开数据

标签:蛋白质组学,糖基化,机器学习,生物信息学,预测模型,NGlyDE,深度学习,生物数据

数据概述: 该数据集包含来自多个来源的蛋白质序列数据,记录了蛋白质N-糖基化位点信息。主要特征如下: 时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态蛋白质组学研究数据集。 地理范围:数据来源于蛋白质组学研究,覆盖范围取决于蛋白质数据库的收录情况,通常包括全球范围内的蛋白质序列信息。 数据维度:数据集包括蛋白质序列、糖基化位点标记、以及蛋白质序列的特征向量(例如,氨基酸残基的理化性质、二级结构预测等)。 数据格式:主要数据格式为CSV文件,如“Glycobiology_NGlyDE_Training_Positive_1821_Negative_901.csv”,包含蛋白质序列、糖基化位点信息以及提取的特征。此外,还包括H5格式的深度学习模型文件(.h5),以及用于特征提取和模型训练的Python脚本(.py)和Jupyter Notebook (.ipynb) 文件。 来源信息:数据来源于生物信息学研究,可能整合了UniProt等蛋白质数据库,并经过了预处理和特征提取。 该数据集适合用于蛋白质N-糖基化位点的预测模型的构建、训练和评估,以及相关生物学机制的研究。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于蛋白质组学、生物信息学和机器学习交叉领域的学术研究,例如,糖基化修饰对蛋白质功能和结构的影响研究、基于深度学习的糖基化位点预测模型构建等。 行业应用:为生物制药和生物技术行业提供数据支持,例如,用于优化抗体药物的糖基化修饰,提高药物的稳定性和疗效。 决策支持:支持蛋白质工程和药物设计领域的决策制定,帮助优化蛋白质的表达和修饰策略。 教育和培训:作为生物信息学、机器学习和蛋白质组学课程的辅助材料,帮助学生和研究人员理解糖基化修饰,并实践相关的预测模型。 此数据集特别适合用于探索蛋白质糖基化修饰的规律,构建高性能的预测模型,并应用于蛋白质工程和药物设计等领域,从而提升蛋白质药物的研发效率和治疗效果。

数据与资源

附加信息

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版本 1.0
最后更新 五月 21, 2025, 03:42 (UTC)
创建于 五月 21, 2025, 03:17 (UTC)