蛋白质相互作用关系分析数据集Protein-ProteinInteractionData-emanfun
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质相互作用, 生物信息学, 蛋白质组学, 相互作用网络, 基因组学, 数据挖掘, 机器学习, 蛋白质结构
数据概述:
该数据集包含来自公共数据库的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据,记录了蛋白质之间的相互作用关系及其相关属性。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间戳,可视为某个时间点的快照。
地理范围:数据主要聚焦于人类蛋白质,但可能包含其他物种的蛋白质数据。
数据维度:包括蛋白质的唯一标识符(stringId_A, stringId_B)、蛋白质的常用名称(preferred_A, preferred_B)、物种的NCBI分类号(ncbiTaxonId)以及各种评分指标(score, nscore, fscore, pscore, ascore, escore, dscore, tscore),用于评估相互作用的强度和可靠性。
数据格式:CSV格式,文件名为PPIDSR.csv,方便进行数据分析和处理。
来源信息:数据来源于公共数据库,已进行标准化,包含蛋白质的各种属性和相互作用信息。
该数据集适合用于蛋白质相互作用网络构建、蛋白质功能预测、药物靶点发现等研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、蛋白质组学、系统生物学等领域的研究,如蛋白质相互作用网络构建、相互作用预测、功能富集分析等。
行业应用:为生物制药、药物研发等行业提供数据支持,特别是在靶点发现、药物筛选、疾病机制研究等方面。
决策支持:支持科研人员进行蛋白质相互作用分析,辅助其进行实验设计、结果解读和研究方向选择。
教育和培训:作为生物信息学、蛋白质组学等课程的教学素材,帮助学生理解蛋白质相互作用的复杂性和重要性。
此数据集特别适合用于探索蛋白质之间的相互作用模式,预测蛋白质功能,以及研究疾病相关的蛋白质相互作用网络,从而加速生物医学研究的进程。