数据集概述
本数据集聚焦淡水环境中Telonemia原生生物的全球分布研究，包含18S rRNA基因序列、序列比对与系统发育树文件，以及5份补充表格，涵盖CARD-FISH计数、理化参数、宏基因组组装详情、序列信息、丰度比较及环境相关性分析等内容，为该类原生生物的分布特征研究提供基础数据。
文件详解
- 序列文件
- 文件名称：final_telonema_sequences_400bp_v3.fasta.gz
- 文件格式：FASTA.GZ
- 字段映射介绍：包含本研究中使用的所有Telonemia 18S rRNA基因序列
- 比对与树文件包
- 文件名称：mafft-alignments-trees.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 字段映射介绍：包含18S序列在95%、96%、97%、98%、99%、100%核苷酸一致性水平的mafft比对结果，以及使用iqtree构建的最大似然树和iqtree日志
- 文件名称：pasta-alignments-trees.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 字段映射介绍：包含18S序列在95%、96%、97%、98%、99%、100%核苷酸一致性水平的pasta比对结果，以及使用iqtree构建的最大似然树和iqtree日志
- 补充表格文件
- 文件名称：Supplementary Table S1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Telonemia的CARD-FISH计数数据及理化参数
- 文件名称：Supplementary Table S2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含所用宏基因组组装的详细信息
- 文件名称：Supplementary Table S3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含所有Telonemia 18S rRNA序列的详细信息
- 文件名称：Supplementary Table S4.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含CARD-FISH与18S rRNA基因丰度的比较数据
- 文件名称：Supplementary Table S5.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Telonemia的CARD-FISH丰度与环境参数的相关性分析结果
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，概述文件内容及可用资源
适用场景
- 淡水原生生物多样性研究: 利用18S rRNA基因序列分析淡水环境中Telonemia原生生物的物种多样性与分布特征
- 原生生物系统发育分析: 通过序列比对结果和系统发育树，探究Telonemia原生生物的进化关系
- 环境因子相关性研究: 基于补充表格中的理化参数与丰度数据，分析Telonemia原生生物丰度与环境因子的关联
- 宏基因组数据整合分析: 结合宏基因组组装详情，开展淡水生态系统中Telonemia原生生物的宏基因组学研究
- 生物丰度评估方法验证: 对比CARD-FISH与18S rRNA基因的丰度数据，验证不同检测方法的一致性与适用性
