单细胞RNA测序基因表达数据集Single-cellRNASequencingGeneExpressionDataset-calumwilsonsipbs
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞RNA测序, 基因表达, 转录组学, 生物信息学, 细胞异质性, 数据分析, 细胞分型, 机器学习
数据概述:
该数据集包含来自单细胞RNA测序实验的基因表达数据,记录了在特定生物样本中,单个细胞的转录组信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未标明具体时间,通常用于静态分析。
地理范围:数据未限制特定地理区域,取决于原始实验的样本来源。
数据维度:数据集包含每个细胞中各种基因的表达量,以及细胞的元数据信息,如细胞类型、样本来源等。主要数据项包括基因名称、细胞ID和表达量值。
数据格式:CSV格式,每个文件对应一个样本,文件名为 GSMXXXXXXX_CXXXctr_raw_counts.csv,便于数据分析和处理。
来源信息:数据来源于公共数据库,例如GEO(Gene Expression Omnibus)数据库,已进行原始测序数据的比对和counts统计。
该数据集适合用于基因表达分析、细胞类型鉴定、细胞间通讯研究等。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学、细胞生物学等领域的学术研究,如细胞异质性分析、基因共表达网络构建、疾病相关基因发现等。
行业应用:可以为生物技术和制药行业提供数据支持,特别是在药物靶点发现、个性化医疗、疾病诊断等领域。
决策支持:支持生物医学研究中的实验设计、数据分析和结果验证,促进对疾病发生发展机制的理解。
教育和培训:作为生物信息学、转录组学等课程的实训数据,帮助学生和研究人员熟悉单细胞RNA测序数据分析流程。
此数据集特别适合用于探索细胞内基因表达的复杂调控机制,以及不同细胞类型在特定生物过程中的作用,帮助用户深入理解生物学现象。