单细胞转录组基因表达谱数据集Single-CellTranscriptomeGeneExpressionProfiles-yanasem
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞, 转录组, 基因表达, 生物信息学, 细胞分析, 高通量测序, 机器学习, 细胞异质性
数据概述:
该数据集包含来自单细胞RNA测序的数据,记录了细胞水平上的基因表达信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标明时间,可视为特定时间点的细胞基因表达快照。
地理范围:数据来源未明确,但适用于生物学研究,不限定地理范围。
数据维度:数据集包含多个CSV文件,主要数据项包括:细胞ID(cell_id),以及每个细胞中各个基因的表达量,基因以ENSG开头的基因ID进行标识。
数据格式:数据以CSV格式提供,便于数据分析和处理,包括X.csv、Xt.csv、meta.csv、prerpocessed_y.csv、xt0_head.csv和xt_head.csv等文件,其中xt_head.csv包含了基因表达的列名信息。
来源信息:数据来源于单细胞转录组测序实验,已进行初步处理,如标准化、降噪等。
该数据集适合用于细胞基因表达分析、细胞类型鉴定、细胞间相互作用研究以及基因功能分析等。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学、细胞生物学等领域的学术研究,如细胞分化、细胞状态转变、疾病发生发展机制研究等。
行业应用:可以为生物医药行业提供数据支持,尤其在药物靶点发现、个性化医疗、疾病诊断等方面。
决策支持:支持生物医药企业在药物研发、临床试验设计等方面的决策。
教育和培训:作为生物信息学、基因组学等课程的实训数据,帮助学生和研究人员熟悉单细胞RNA测序数据分析流程。
此数据集特别适合用于探索细胞异质性,研究基因表达调控机制,以及发现新的生物标志物,帮助用户深入理解生物体内的细胞行为。