数据集概述
本数据集围绕岛屿植物分类群Cyrtandra的多样化动态展开，验证其是否符合海洋岛屿生物地理学通用动态模型（GDM）预测。核心内容包括生物地理分析、扩散方向推断及多样化速率模拟，覆盖东南亚及太平洋岛屿区域，提供多类型分析文件与结果。
文件详解
- 说明文档与数据描述:
- README.md: Markdown格式说明文档，含数据集基本信息、贡献者及联系信息
- distribution.txt: TXT格式，可能包含Cyrtandra物种分布数据
- 生物地理分析脚本与参数文件:
- complete_BioGeoBeaRs_script.R: R语言脚本，用于生物地理分析
- equal_rates_manual_dispersal_multipliers.txt、sahul_nexus_manual_dispersal_multipliers.txt等10个TXT文件: 生物地理模型扩散速率参数配置文件
- 系统发育树文件:
- no_out_tree.newick: Newick格式系统发育树
- BEAST_tree.tre、BAYES_tree.tre: TRE格式贝叶斯推断系统发育树
- ML_tree.cut1000: 最大似然法系统发育树结果文件
- 进化分析输入文件:
- BEAST_bdi_input.xml、BEAST_yule_input.xml: XML格式BEAST进化分析输入文件
- cyr_alignment.nex: Nexus格式序列比对文件
- 分析结果文件:
- DECJ100BSMs_v1.pdf、DEC_J_single_stochastic_map_n1.pdf: PDF格式生物地理模型结果可视化文件
适用场景
- 岛屿生物地理学研究: 分析Cyrtandra属植物在东南亚及太平洋岛屿的扩散路径与多样化模式
- 进化生物学分析: 探究岛屿植物适应性辐射过程及驱动机制
- 生物地理模型验证: 验证通用动态模型（GDM）对岛屿植物类群多样化的预测能力
- 系统发育方法应用: 复现基于BEAST、BioGeoBeaRs等工具的系统发育与生物地理联合分析流程
- 植物生态学研究: 分析岛屿植物形态特征（如生活型、花部性状）与生态位分化的关系
