数据集概述
本数据集包含灰礁鲨（Carcharhinus amblyrhynchos）种群进化历史研究的关键数据，涵盖印度-太平洋区域173个个体的RAD-seq基因位点分析结果，涉及种群扩张、基因连通性及遗传结构等内容，为该濒危物种的保护管理提供科学依据。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含各文件内容摘要，如SFS文件为所有采样点的位点频率谱，VCF文件为种群结构建模所用的变异检测文件等。
- VCF.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含种群结构建模相关的变异检测文件，如用于SNMF、PCA、DAPC分析的random_SNP_clean_173.vcf.gz，以及用于FST、IBD分析的random_SNP_clean_FST_168.vcf.gz。
- Permeability_values_RE.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含与种群扩张相关的渗透率数值数据。
- SFS.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含所有采样点的位点频率谱（Site Frequency Spectrum）数据。
数据来源
论文“Like a rolling stone: Colonization and migration dynamics of the gray reef shark (Carcharhinus amblyrhynchos)”
适用场景
- 濒危物种保护管理: 基于种群遗传结构分析结果，制定灰礁鲨的跨区域保护策略。
- 海洋生物进化研究: 探究印度-澳大利亚群岛作为生物多样性来源对鲨鱼种群扩张的影响。
- 种群基因连通性分析: 分析灰礁鲨在印度-太平洋区域的基因交流模式及隔离距离效应。
- 物种对比生态学研究: 对比灰礁鲨与同域分布的黑鳍礁鲨（Carcharhinus melanopterus）的遗传结构差异，揭示生活史特征对种群动态的影响。
