德国SARS_CoV_2基因组序列数据集

数据集概述

该数据集为德国SARS-CoV-2基因组序列数据,是病原体监测的核心部分,用于理解病毒传播、遗传特性及变异情况,支持突变检测、传播路径追踪等研究,旨在通过基因组监测观察病毒变化并公开数据供科研分析。

文件详解

该数据集包含7个文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: - SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz: 压缩FASTA格式,包含SARS-CoV-2基因组序列数据。 - SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz: 压缩TSV格式,可能包含序列相关的结构化数据。 - 变异信息文件: - SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.tsv: TSV格式,字段包括LINEAGE(谱系)、WHO_LABEL(WHO命名)、CONTRIBUTING_LINEAGES(贡献谱系)、COLOR(颜色标记)、variant_category(变异类别)。 - SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv: TSV格式,字段包括LINEAGE(谱系)、WHO_LABEL(WHO命名)、CONTRIBUTING_LINEAGES(贡献谱系)。 - 数据描述文件: - datapackage.json: JSON格式,包含数据集名称、标题、描述等元数据信息。 - 文档文件: - [Dokumentation]_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland.pdf: PDF格式,为数据集的说明文档。 - 压缩文件: - Metadaten.zip: ZIP格式,可能包含数据集的元数据文件。

适用场景

  • 病毒变异研究: 分析SARS-CoV-2病毒谱系演变、变异类别及WHO命名对应关系。
  • 流行病学分析: 支持病毒传播路径追踪、亲缘关系重建及耐药性预测。
  • 公共卫生监测: 为德国及全球SARS-CoV-2病毒监测提供基因组数据支持。
  • 科研数据共享: 供科研人员开展病毒基因组相关的独立分析与研究。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 199.44 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。