数据集概述
本数据集聚焦熊蜂拟态颜色变异的遗传机制研究,通过组织/阶段特异性转录组分析及qRT-PCR验证,揭示Hox基因Abd-B下游调控颜色模式分化的基因网络,包括中间发育基因、黑色素与氧化还原相关基因等,涉及昆虫褐黑素合成相关潜在基因,为理解熊蜂颜色模式发育及适应性表型辐射提供数据支持。
文件详解
- Males_qPCR_raw_analyzed.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:雄性熊蜂qPCR实验的原始分析数据,包含基因表达量的原始检测值与分析结果
- Worker_qPCR_raw_analyzed.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:工蜂qPCR实验的原始分析数据,包含基因表达量的原始检测值与分析结果
- RNA-Seq_DEG_list.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:RNA-Seq差异表达基因(DEG)列表,记录转录组分析中显著差异表达的基因信息
- DESeq2_script.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:基于Biostar Handbook的DESeq2分析脚本,用于转录组数据的差异表达分析,包含代码注释与来源说明
数据来源
论文“Developmental transcriptomics reveals a gene network driving mimetic color variation in a bumble bee”
适用场景
- 进化遗传学研究:分析熊蜂拟态颜色变异的基因型与表型关联机制
- 发育生物学分析:探究Hox基因Abd-B下游调控颜色模式分化的基因网络
- 昆虫色素合成研究:验证昆虫褐黑素合成相关潜在基因的功能与调控机制
- 适应性表型进化分析:解析熊蜂颜色模式适应性辐射的分子基础
- 转录组数据分析方法参考:基于DESeq2脚本的差异表达基因分析流程复用