数据集概述
本数据集包含遗袋貂(Dromiciops gliroides)冬眠期间的功能转录组学分析相关文件,涵盖差异表达基因、原始计数、DESeq2分析结果及组装转录组,与发表于《Molecular Ecology》的手稿相关联。数据集共包含四个文件,支持冬眠适应性保护功能的基因调控研究。
文件详解
- 组装转录组文件
- 文件名称:monito_transcriptome.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含遗袋貂的组装转录组序列信息,记录转录本的核苷酸序列数据
- 脑组织DESeq2分析文件
- 文件名称:All_deseq2_Brain.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录脑组织中基因的DESeq2差异表达分析结果,包含基因表达量、差异倍数、显著性水平等统计信息
- 肌肉组织DESeq2分析文件
- 文件名称:All_deseq2_Muscle.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:记录肌肉组织中基因的DESeq2差异表达分析结果,包含基因表达量、差异倍数、显著性水平等统计信息
- 肝脏组织DESeq2分析文件
- 文件名称:All_deseq2_Liver.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:记录肝脏组织中基因的DESeq2差异表达分析结果,包含基因表达量、差异倍数、显著性水平等统计信息
数据来源
论文“Data from A functional transcriptomics analysis in the relict marsupial Dromiciops gliroides reveals adaptive regulation of protective functions during hibernation”
适用场景
- 冬眠适应性基因调控研究: 分析遗袋貂冬眠期间保护功能相关基因的差异表达模式,探究适应性调控机制
- 转录组学数据挖掘: 利用组装转录组和原始计数数据,开展基因功能注释与转录本结构分析
- 组织特异性表达分析: 对比脑、肌肉、肝脏组织的DESeq2结果,研究冬眠对不同组织基因表达的影响
- 保护生物学分子机制研究: 基于差异表达基因数据,解析冬眠期间保护性生理功能的分子调控网络