数据集概述
本数据集包含果蝇胶质细胞和神经元中WDFY3/Bchs过表达后的基因表达差异分析及GO富集分析结果,共6个文件。数据通过对比过表达组与对照组的基因表达水平,筛选差异表达基因,并对其进行功能富集分析,为研究Bchs过表达对神经功能的影响提供基因层面的依据。
文件详解
- 差异表达基因分析文件(共3个)
- 文件名称:TabS1_Differentially_expressed_genes_of_glial_Bchs_overexpression_flies.xlsx、TabS2_Differentially_expressed_genes_of_neuronal_Bchs_overexpression_flies.xlsx、TabS3_Genes_differentially_expressed_in_glial_and_neuronal_Bchs_overexpression_flies.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因表达水平的对比数据,核心字段有baseMean(所有样本标准化计数的均值)、log2FoldChange(过表达组与对照组基因表达水平的log2差值)、lfcSE(log2倍变化的标准误差)、stat(Wald统计量)、pvalue(Wald检验p值)、padj(经Benjamini-Hochberg法校正的p值);TabS3额外包含Glial/neuronal direction(胶质细胞和神经元中基因表达的上调/下调方向)、concordance(胶质细胞和神经元中基因表达失调方向的一致性)。
- GO富集分析文件(共3个)
- 文件名称:TabS4_GO_enrichment_analysis_glial_Bchs_overexpression_flies.xlsx、TabS5_GO_enrichment_analysis_neuronal_Bchs_overexpression_flies.xlsx、TabS6_GO_enrichment_analysis_of_genes_differentially_expressed_in_glial_and_neuronal_Bchs_overexpression_flies.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含差异表达基因的GO功能富集结果,核心字段为经家族wise错误率多重校正后的padj值(padj<0.05为显著富集的GO模块)。
适用场景
- 神经生物学研究:分析Bchs过表达对果蝇胶质细胞和神经元基因表达的影响,探究其对神经功能的作用机制。
- 基因功能分析:通过差异表达基因的GO富集结果,挖掘Bchs过表达相关的生物学过程和分子功能。
- 疾病机制研究:为研究与WDFY3/Bchs相关的神经退行性疾病提供果蝇模型的基因表达参考。
- 基因调控网络构建:基于差异表达基因的重叠与方向一致性,构建Bchs过表达下的基因调控网络。