数据集概述
本数据集聚焦澳大利亚海狮(Neophoca cinerea)寄生钩虫(Uncinaria sanguinis)的遗传多样性研究,通过分析线粒体DNA细胞色素c氧化酶I基因片段,探究宿主分布与生态对寄生虫进化历史的影响。数据包含45种独特钩虫单倍型,揭示其高基因流动特征,挑战宿主出生地忠诚度限制寄生虫扩散的假设。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README_for_DRYAD.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集包含的cox1基因序列文件格式,包括FASTA、NEXUS、MEGA格式文件,以及各文件对应的样本信息(如Dataset1to3.meg含56个寄生虫cox1序列,DHR.fas/.nex含危险礁 colony 17个样本序列等)
- 压缩包文件
- 文件名称:DRYAD.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含多种格式的钩虫cox1基因序列文件,具体文件及格式可参考README文档说明
数据来源
DRYAD数据库(关联研究论文:Unexpected absence of genetic separation of a highly diverse population of hookworms from geographically isolated hosts)
适用场景
- 寄生虫遗传学研究:分析钩虫种群的遗传多样性、单倍型结构及基因流动模式
- 宿主-寄生虫共进化分析:探究澳大利亚海狮分布与钩虫遗传结构的关联,验证宿主生态学对寄生虫扩散的影响
- 海洋保护生物学应用:为濒危海狮种群的寄生虫防控策略提供遗传数据支持
- 进化生物学研究:通过钩虫基因多样性数据,研究寄生生物跨地理隔离宿主的扩散机制