数据集概述
本数据集为热带蜥蜴Carlia amax的谱系与种群历史研究数据,包含基于外显子捕获技术生成的2000余个基因座的序列及SNP数据,用于识别该物种的分化谱系、重建谱系关系并推断种群动态历史,为理解热带低扩散类群的生物多样性形成机制提供支持。
文件详解
- 文件名称:README_for_Dryad Repository.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明文档,记录样本信息、文库名称及NCBI SRA数据库的访问编号,关联生物项目PRJNA289283的样本数据。
- 文件名称:Dryad Repository.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,包含与研究相关的原始数据及代码文件,具体内容需解压后查看。
数据来源
Dryad Repository(关联论文:Potter S等,Phylogenomics at the tips: inferring lineages and their demographic history in a tropical lizard, Carlia amax)
适用场景
- 进化谱系分析:利用核SNP数据识别Carlia amax的分化谱系,重建谱系间的系统发育关系。
- 种群动态历史研究:通过溯祖分析推断种群扩张、收缩及隔离历史,验证平衡距离隔离模型。
- 生物地理学研究:分析谱系分布与地理景观的关联,识别生物多样性热点区域。
- 基因组学方法应用:探索外显子捕获技术在非模式生物种群与系统发育研究中的应用价值。