找到22个数据集

标签: NCBI SRA

过滤结果
  • D_25_00182_手稿图表生成数据

    2026年2月9日 30 183 124

    数据集概述 本数据集包含手稿图表生成所用的全部数据(序列数据除外,序列数据已提交至NCBI SRA的BioProject PRJNA1148117),支持科学研究中的图表制作与结果呈现。 文件详解 文件名称:D-25-00182_data.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg
  • SNP_Based_淡水黄貂鱼杂交与种群结构检测标记数据

    2026年1月30日 30 160 47

    数据集概述 本数据集包含对淡水黄貂鱼Potamotrygon motoro和Potamotrygon falkneri两种物种的单核苷酸多态性(SNP)标记识别与验证数据。通过ddRAD技术获取454测序数据,筛选出143个候选SNP,其中82个成功验证,61个具有多态性,可用于种群分析和杂交检测。数据集共包含4个文件。 文件详解...
    packageimg
  • Eulachon_Based_太平洋胡瓜鱼种群分化遗传标记研究数据

    2026年1月27日 0 5 2

    数据集概述 本数据集包含太平洋胡瓜鱼(Eulachon)种群分化研究的遗传标记数据,涉及阿拉斯加库克湾至哥伦比亚河沿岸12个种群的中性和适应性遗传变异分析。通过RAD测序发现4104个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中193个为适应性位点。数据支持种群结构、遗传多样性及有效种群大小的研究,为该物种的保护和管理提供基因组学依据。 文件详解 关键信息文件...
    packageimg
  • NCBI_SRA_Based_地中海海域宏基因组组装基因组与病毒基因组数据_2019_2022

    2026年1月12日 30 14 11

    数据集概述 本数据集包含地中海西部近海单站位采集的四个海洋样本的宏基因组组装基因组(MAGs)和宏基因组组装病毒基因组(MAVGs)。样本覆盖夏季分层水体的不同深度(上层透光层、深层叶绿素最大值层、下层透光层)及冬季混合期,采用Illumina NextSeq短读长和PacBio Sequel II长读长技术测序,共包含3个文件。 文件详解...
    packageimg
  • Zenodo_Source_玉米土壤非生物与生物因子互作_杂种优势研究数据

    2026年1月21日 30 5 2

    数据集概述 本数据集包含论文"The interaction between abiotic and biotic soil factors modulates heterosis expression in...
    packageimg
  • Dryad_澳大利亚西北部Carlia石龙子姐妹种多样化与种群历史研究数据

    2026年1月21日 30 180 151

    数据集概述 本数据集为澳大利亚西北部Carlia属石龙子姐妹种(热带特化种Carlia johnstonei与广适种C. triacantha)的种群研究数据,包含线粒体DNA(mtDNA)及约2500个外显子序列数据,用于分析两者的历史存续规模与种群波动差异,验证热带特化种对气候变化更敏感的假说。 文件详解 README_for_Dryad.txt...
    packageimg
  • Dryad_Based_外显子捕获系统发育基因组学蜥蜴演化研究数据2015

    2026年1月21日 30 97 60

    数据集概述 本数据集为外显子捕获系统发育基因组学研究相关数据,针对澳大利亚石龙子蜥蜴(冠群年龄约8000万年)开展,使用目标富集技术测序约3000个蛋白编码外显子,研究不同系统发育分化水平下目标基因座的富集效率,同时开发了低至中等分化样本的分析工作流程。 文件详解 README_for_dryad_34274.zip.txt 文件格式:TXT...
    packageimg
  • BeONE_Project_Escherichia_coli基因组组装数据集

    2026年1月20日 30 43 11

    数据集概述 本数据集包含BeONE Consortium收集的308株大肠杆菌样本的基因组组装数据,以及来自ENA或NCBI SRA的1999株大肠杆菌公开基因组组装补充数据。数据经标准化处理,包含组装统计信息、基因分型及样本元数据,支持大肠杆菌的基因组学研究与分析。 文件详解 BeONE_Ec_metadata.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg
  • Aegilops_Genotyping_小麦近缘种基因组特征与基因库整理数据集

    2026年1月20日 30 210 187

    数据集概述 本数据集包含1041份Aegilops属23个物种材料的基因分型测序(GBS)相关数据,由堪萨斯州立大学小麦遗传与资源中心(WGRC)维护。数据涵盖原始测序关联信息、过滤后的SNP矩阵、分类信息等12个文件,用于探索野生小麦近缘种Aegilops的遗传特征,同时对基因库材料进行分类修正与冗余筛选。 文件详解 说明文档...
    packageimg
  • FIV_Based_HIV感染者COVID_19动物模型基线特征与病毒变异数据

    2026年1月19日 30 208 40

    数据集概述 本数据集包含HIV感染者COVID-19 FIV模型的动物组基线特征数据,以及通过viral_variant_caller和SNPGenie流程生成的病毒变异分析结果,涉及基因差异、群体多样性等关键指标,为相关医学研究提供结构化数据支持。 文件详解 数据文件 文件名称:variant_summary_20230605.xlsx...
    packageimg
  • Dryad_Based_热带蜥蜴Carlia_amax谱系分化与种群历史研究数据_2016

    2026年1月12日 30 78 16

    数据集概述 本数据集为热带蜥蜴Carlia amax的谱系与种群历史研究数据,包含基于外显子捕获技术生成的2000余个基因座的序列及SNP数据,用于识别该物种的分化谱系、重建谱系关系并推断种群动态历史,为理解热带低扩散类群的生物多样性形成机制提供支持。 文件详解 文件名称:README_for_Dryad Repository.txt 文件格式:TXT...
    packageimg
  • Zenodo_Source_Data_帕金森病与炎症性肠病肠道微生物组比较分析数据

    2026年1月15日 30 146 74

    数据集概述 本数据集为帕金森病(PD)与炎症性肠病(IBD)肠道微生物组比较分析的研究数据,包含UFPF、Wallen PD、HMP2 IBD三个数据集的后质控及分类功能分析结果,涉及PD患者、IBD患者及健康对照的肠道菌群特征,重点关注短链脂肪酸产生菌的 depletion情况,为探究两种疾病的微生物组关联提供结构化数据支持。 文件详解...
    packageimg
  • E_MTAB_6422_PRJEB24664_Based拟南芥生命周期基因表达图谱数据

    2026年1月14日 30 45 24

    数据集概述 本数据集为拟南芥(Col-0生态型野生型)全生命周期基因表达图谱,基于RNA-Seq技术构建36个基因表达文库,覆盖幼苗、莲座叶、根、花序、花、果实荚、种子等组织部位,以及2叶期、6叶期、12叶期、衰老期等发育阶段,每个组织和发育阶段包含3个生物学重复,记录了不同年龄样本的转录程序特征。 文件详解...
    packageimg
  • PRJNA949139_BioProject_肉鸡孵化温度对肺转录组与表观遗传影响研究数据

    2026年1月12日 30 66 43

    数据集概述 本数据集包含肉鸡在不同日龄(7日、15日、33日)和不同处理(孵化蛋壳温度、大肠杆菌感染、IBV疫苗接种)下的肺组织转录组与表观遗传数据,以RDS、TXT和Excel格式存储,共23个文件,用于研究早期孵化温度对肉鸡后期免疫与健康的影响机制。 文件详解 RDS文件(11个)...
    packageimg
  • Wolbachia_Read_mapping_NCBI_SRA_SRP091004_测序数据比对代码与QC数据

    2025年12月28日 30 190 170

    数据集概述 本数据集包含针对Wolbachia的下一代测序数据比对相关的代码、日志文件及质量控制(QC)数据,NCBI SRA登录号为SRP091004。Wolbachia测序并非项目核心目标,而是为最大化从以果蝇为宿主的原始基因组测序数据中提取的信息量而开展的工作。 文件详解 代码、日志文件及QC数据...
    packageimg
  • 帕金森病宏基因组学与肠道微生物组关联数据集

    2025年12月22日 30 176 29

    数据集概述 该数据集围绕帕金森病(PD)与肠道微生物组的关联展开,包含大规模粪便样本宏基因组测序的处理后数据及分析代码。通过物种、基因和通路层面的差异分析,揭示PD患者肠道菌群的广泛失调特征,为PD发病机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_Code_24Oct2022.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
    packageimg
  • 球形棕囊藻群体基因表达数据集

    2025年12月14日 30 164 141

    数据集概述 本数据集包含球形棕囊藻群体与单体形态的基因表达差异研究数据,涵盖转录组组装、基因表达定量及差异分析结果,支持该藻群体形成的资源消耗型防御功能研究。 文件详解 转录组组装文件:...
    packageimg
  • 赞比亚小麦瘟疫情全球大流行谱系独立引入基因组分析数据集

    2025年12月12日 30 19 6

    数据集概述 本数据集基于OpenWheatBlast倡议共享的全基因组测序数据,分析赞比亚小麦瘟疫情菌株与不同宿主稻瘟病菌的基因组分化,验证其与孟加拉国疫情菌株的相似性及可能的南美起源,为小麦瘟全球传播研究提供基因组证据。 文件详解 文件名称: Document_WheatBlast_Zambia_Croll__01April2021.pdf...
    packageimg
  • Panicum_hallii重组自交系群体_HAL2_FIL2_遗传图谱数据集

    2025年12月7日 30 178 96

    数据集概述 本数据集记录了Panicum hallii内陆品系HAL2与沿海品系FIL2杂交产生的重组自交系(RIL)群体遗传图谱构建方法,包含四百四十一株RIL个体的九百零一个标记基因型数据,原始序列可通过NCBI SRA项目PRJNA701489获取。 文件详解 文档文件:...
    packageimg
  • 二倍体A基因组小麦物种遗传特征与基因库整理数据集

    2025年12月5日 30 88 42

    数据集概述 本数据集包含美国堪萨斯州立大学小麦遗传资源中心(WGRC)保存的约930份二倍体A基因组小麦物种(乌拉尔图小麦、栽培一粒小麦、野生一粒小麦)的遗传特征分析数据,通过GBS技术鉴定SNP标记,用于遗传多样性、群体结构分析及基因库整理。 文件详解 基础信息文件: Agenome.sample_info.txt(TXT格式):样本基础信息文件...
    packageimg