数据集概述
本数据集包含针对Wolbachia的下一代测序数据比对相关的代码、日志文件及质量控制（QC）数据，NCBI SRA登录号为SRP091004。Wolbachia测序并非项目核心目标，而是为最大化从以果蝇为宿主的原始基因组测序数据中提取的信息量而开展的工作。
文件详解
- 代码、日志文件及QC数据
- 文件名称：包含error_rates.zip、insert_sizes.zip、quality_by_cycle.zip、baseCovDistr.zip、qualDistrMetrics.zip、realignment_intervals.zip、readLengthDistr.zip、aligment_summary_metrics.zip等
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含测序数据比对过程中的错误率、插入片段大小、循环质量、碱基覆盖度分布、质量分布指标、重新比对区间、读长分布、比对汇总指标等QC数据及相关代码、日志文件
数据来源
NCBI SRA（登录号SRP091004）、预印本论文“Whole genome resequencing of a laboratory-adapted Drosophila melanogaster population sample”
适用场景
- 基因组测序数据比对分析：用于研究Wolbachia下一代测序数据的比对流程及结果
- 测序数据质量控制研究：分析测序数据的错误率、插入片段大小、循环质量等QC指标
- 基因组信息提取优化：探索从宿主（果蝇）原始基因组测序数据中最大化提取Wolbachia信息的方法
- 生物信息学代码与流程参考：为相关测序数据比对及QC分析提供代码和流程参考
