数据集概述
本数据集为帕金森病（PD）与炎症性肠病（IBD）肠道微生物组比较分析的研究数据，包含UFPF、Wallen PD、HMP2 IBD三个数据集的后质控及分类功能分析结果，涉及PD患者、IBD患者及健康对照的肠道菌群特征，重点关注短链脂肪酸产生菌的 depletion情况，为探究两种疾病的微生物组关联提供结构化数据支持。
文件详解
- 文件名称：readme.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明Source Data文件各工作表内容，解释三个数据集（UFPF、Wallen PD、HMP2 IBD）的样本类型及数据背景，指引查看论文获取数据收集、处理和分析的详细信息。
- 文件名称：Key Resource Table.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：可能包含研究中关键资源的信息，如数据来源、分析工具等（基于研究常规结构推断）。
- 文件名称：Source Data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含三个数据集的后质控、分类及功能分析数据，涉及肠道菌群的分类组成、功能通路（如短链脂肪酸合成通路）等信息，支撑论文图表及结果分析。
数据来源
Zenodo（关联论文：Comparative analysis of Parkinson's and inflammatory bowel disease gut microbiomes reveals shared butyrate-producing bacteria depletion，预印本DOI：10.1101/2024.04.26.591350；原始测序数据及元数据存于NCBI SRA BioProject PRJNA1096686）
适用场景
- 神经退行性疾病与肠道疾病关联研究：分析PD与IBD肠道微生物组的共享及独特特征，探究菌群失调在两病关联中的作用。
- 短链脂肪酸产生菌功能研究：基于菌群及通路数据，研究Roseburia intestinalis等菌的depletion对疾病发生的影响。
- 微生物组疾病标志物筛选：挖掘PD与IBD共有的肠道微生物组标志物，为疾病诊断或风险评估提供依据。
- 肠道微生物组功能通路分析：解析短链脂肪酸合成通路在PD与IBD中的变化，探究代谢通路与疾病的关联。
