数据集概述
本数据集包含地中海西部近海单站位采集的四个海洋样本的宏基因组组装基因组(MAGs)和宏基因组组装病毒基因组(MAVGs)。样本覆盖夏季分层水体的不同深度(上层透光层、深层叶绿素最大值层、下层透光层)及冬季混合期,采用Illumina NextSeq短读长和PacBio Sequel II长读长技术测序,共包含3个文件。
文件详解
- Table_MAG_MAVG_genomic_info.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含MAGs和MAVGs的基因组信息表格,具体字段未提供预览,推测涵盖基因组基本特征、组装指标等核心信息
- MAVG-LRMED.tar.gz
- 文件格式:TAR.GZ(压缩归档文件)
- 字段映射介绍:宏基因组组装病毒基因组(MAVGs)相关数据的压缩包,具体内容未提供预览
- MAG-LRMED.tar
- 文件格式:TAR(归档文件)
- 字段映射介绍:宏基因组组装基因组(MAGs)相关数据的归档包,具体内容未提供预览
数据来源
NCBI SRA数据库(BioProject登录号PRJNA1088973、PRJNA674982)
适用场景
- 海洋微生物群落结构分析: 研究地中海不同水层及季节的微生物群落组成与多样性
- 病毒-宿主相互作用研究: 通过MAVGs数据探索海洋环境中病毒与微生物的生态关系
- 宏基因组组装技术评估: 对比长读长与短读长测序技术在海洋宏基因组组装中的应用效果
- 海洋生态系统功能研究: 基于MAGs的功能注释分析海洋微生物在碳循环、氮循环等生态过程中的作用
- 气候变化对海洋微生物的影响研究: 分析夏季分层与冬季混合期微生物群落的差异及环境驱动因素