Panicum_hallii重组自交系群体_HAL2_FIL2_遗传图谱数据集

数据集概述

本数据集记录了Panicum hallii内陆品系HAL2与沿海品系FIL2杂交产生的重组自交系(RIL)群体遗传图谱构建方法,包含四百四十一株RIL个体的九百零一个标记基因型数据,原始序列可通过NCBI SRA项目PRJNA701489获取。

文件详解

  • 文档文件:
  • README_PHRILMap.pdf:PDF格式的说明文档,可能包含遗传图谱构建的方法、数据说明及使用指南。
  • R语言数据文件:
  • PHRIL2019_v2.RData:R语言数据格式文件,可能存储了遗传图谱的核心数据或分析结果。
  • CSV数据文件:
  • PHRIL2019_Meta.csv:包含RIL_ID、LIBID、Experiment_Accession等字段的元数据文件。
  • PHRIL2019_phe.csv:包含ind、id等字段的表型数据文件。
  • PHRIL2019_gen.csv:推测为基因型数据文件,具体字段需进一步查看。

数据来源

NCBI SRA archive Umbrella project PRJNA701489

适用场景

  • 植物遗传学研究:用于Panicum hallii遗传图谱解析及QTL定位分析。
  • 分子育种应用:为Panicum hallii品种改良提供遗传标记基础。
  • 群体遗传学分析:探究内陆与沿海品系杂交群体的遗传多样性及连锁不平衡模式。
  • 比较基因组学研究:与其他禾本科植物遗传图谱进行比较分析。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.23 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。