数据集概述
本数据集来自论文“Out of Africa to Madagascar - then back? Molecular phylogenetics and biogeography of tribe Tarchonantheae”，包含该研究的分子序列、系统发育树、分析配置文件等23个文件。核心内容为Tarchonantheae族（菊科）的分子系统发育关系及历史生物地理分析数据，涉及非洲与马达加斯加间的物种扩散事件研究。
文件详解
- 分子序列文件
- 文件名称：AllLoci.fasta、ETS.fasta、ITS.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含核核糖体ITS、ETS及质体rpl16内含子的核苷酸序列数据，用于系统发育分析
- 系统发育树文件
- 文件名称：BEAST_TARCH_tree1.tre至BEAST_TARCH_tree13.tre等17个.tre文件
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：BEAST分析输出的系统发育树文件，记录物种间的进化关系及时代校准信息
- 分析配置文件
- 文件名称：Final_Tarchonanthus_BEAST_Concat.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST分析的参数配置文件，包含序列拼接、模型设置、时钟模型等信息
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据关联的论文DOI链接、文件清单及联系信息
数据来源
Dryad平台（DOI: 10.5061/dryad.bnzs7h4gc）
适用场景
- 植物系统发育研究：利用FASTA序列数据重建Tarchonantheae族的进化关系
- 历史生物地理分析：通过系统发育树及生物地理模型结果，探究物种在非洲与马达加斯加间的扩散历史
- 分子进化模型验证：基于XML配置文件复现BEAST分析流程，验证不同进化模型的适用性
- 生物多样性研究：分析Tarchonantheae族的物种分化时间及地理分布格局，支持生物多样性保护策略制定
