数据集概述
本数据集围绕比目鱼（鲽形目）及其近缘类群的系统发育展开，包含20个基因位点、214个分类单元的分子数据，旨在通过分析碱基组成非平稳性与基因树冲突的关系，解决比目鱼系统发育位置争议，为理解其演化关系提供数据支持。
文件详解
- 主要数据文件：
- ALL_TAXA_20_GENES.nex：NEXUS格式，包含所有214个分类单元、20个基因位点的分子序列数据，用于系统发育分析
- SUBSET_18_GENES.nex：NEXUS格式，包含18个基因位点的子集数据，用于对比分析
- 补充表格文件：
- Supplementary_Table_1.xlsx：Excel格式，可能包含基因位点基本信息、分类单元列表等基础数据
- Supplementary_Table4.docx：Word格式，可能包含基因树冲突分析、碱基组成统计等结果表格
- Supplementary_Table_2.pdf：PDF格式，可能包含碱基组成非平稳性检测结果
- Supplementary_Table_3.pdf：PDF格式，可能包含系统发育分析参数设置、支持率统计等信息
- 补充图表文件：
- FIG_SUPP_1_DNA_AA.pdf：PDF格式，可能展示DNA与氨基酸序列特征、碱基组成分布等图表
- FIG_SUP_2_Subset_trees.pdf：PDF格式，可能展示子集基因位点的系统发育树结构、拓扑冲突等可视化结果
适用场景
- 分子系统学研究：分析碱基组成非平稳性对系统发育推断的影响
- 演化生物学研究：探究比目鱼及其近缘类群的系统发育关系与演化历史
- 生物信息学方法验证：测试非均质模型在解决基因树冲突中的应用效果
- 鱼类演化研究：支持比目鱼分类地位与亲缘关系的相关分析
